SB

Stéphanie Bougeard

61 %
Libre accès
113
Documents
Affiliation actuelle
  • Laboratoire de Ploufragan-Plouzané-Niort [ANSES]
Contact

Domaines de recherche

Statistiques [stat]

Publications

41
18
12
10
4
3
3
3
3
2
2
2
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
7
6
6
6
5
5
5
4
3
3
3
3
3
3
3
3
2
2
2
2
2
2
2
2
2
2
2
2
2
2
2
2
2
2
2
2
2
2
2
2
2
2
2
2
2
2
2
2
2
2
2
2
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
18
15
11
10
10
9
7
7
7
7
7
7
7
7
7
7
7
6
6
6
6
6
6
6
5
5
5
4
4
4
4
4
4
4
3
3
3
3
3
3
3
3
3
3
3
3
3
3
3
3
3
3
3
3
3
3
3
3
2
2
2
2
2
2
2
2
2
2
2
2
2
2
2
2
2
2
2
2
2
2
2
2
2
2
2
2
2
2
2
2
2
2
2
2
2
2
2
2
2
6
4
3
2
2
2
2
2
2
2
2
2
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
11
13
16
12
11
2
6
9
3
6
3
3
2
1
3
3
3
1
5
1
1
1
1
3
1
1
1
2
2
2
2
2
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
68
53
21
7
4
3
2
1
1
1
1

Publications

Multiblock Analysis of Distributional Data

Paula Brito , Ndèye Niang , A. Pedro Duarte Silva , Stéphanie Bougeard

Symbolic Data Analysis Workshop 2025, Jun 2025, Varaždin, Croatia

Communication dans un congrès hal-05153737v1

Explorer les structures d’observations communes, partiellement communes et spécifiques à plusieurs blocs de variables

Stéphanie Bougeard , Jean-Michel Galharret , Mohamed Hanafi

Rencontres de la Société Francophone de Classification (SFC25), Jun 2025, Dijon, France

Communication dans un congrès anses-05509505v1

Multiblock Analysis of Distributional Data

Paula Brito , Ndèye Niang , A. Pedro Duarte Silva , Stéphanie Bougeard

9th conference of Data Science, Statistics, and Visualisation (DSSV 2025), Jul 2025, Kruger National Park, South Africa

Communication dans un congrès hal-05153676v1

Prevalence and diversity of Integrative and Conjugative or Mobilizable Elements carrying antimicrobial resistance genes in Streptococcus suis

Manon Dechêne-Tempier , Stéphanie Bougeard , Valentin Loux , Hélène Chiapello , Virginie Libante et al.

International Conference on type IV secretion system, UMR1128 DynAMic; PROPULS', Feb 2025, Nancy, France

Communication dans un congrès hal-05286237v1

Salmonella strikes harder in the presence of Campylobacter, fueling chicken colonization

Muriel Guyard-Nicodème , Guillaume Larivière-Gauthier , Cyrielle Payen , Laëtitia Bonifait , Sophie Mompelat et al.

I3S 2025, INNOZH, Jun 2025, Saint-Malo, France

Communication dans un congrès anses-05191637v1

Performance of infrared spectroscopy to predict serogroup and ability of adhesion of Listeria monocytogenes compared to genomic analysis

Evelyne Boscher , Stéphanie Bougeard , M. Guy , Emmanuelle Houard , Arnaud Felten et al.

ISOPOL XXI, Matthew Gilmour, Sep 2024, Norwich, UK, United Kingdom

Communication dans un congrès anses-04811451v1

Epizootie d’Influenza Aviaire Hautement Pathogène en France en 2022-2023 : importance des facteurs environnementaux

Maryem Ben Salem , Mathieu Andraud , Stéphanie Bougeard , Sophie Le Bouquin , Virginie Allain et al.

15. Journées de la Recherche Avicole et Palmipèdes à Foie Gras, Mar 2024, Tours, France. pp.236-240

Communication dans un congrès hal-04539486v1

Honey bee health in a world of pathogens and pesticides: measurement and interpretation of large data sets

Marie-Pierre Chauzat , Marion Laurent , Minh Huyen Ton Nu Nguyet , Lucile Caradec , Florence Ghestem et al.

Bee Health Symposium, Jun 2024, Madrid, Spain

Communication dans un congrès anses-04805742v1
Deposit thumbnail

Principal Components Analysis with Optimal Scaling: A way to integrate sensory analysis, physico-chemical measurements and experimental factors.

Evelyne Vigneau , Stéphanie Bougeard

AgroStat 2024, Société Française de Statistique (SFdS) & Polytechnic Institute of Bragança (IPB), Sep 2024, Bragança, Portugal

Communication dans un congrès hal-05039113v1

Mobile genetic elements that carry macrolide-lincosamide and tetracycline resistance genes in Streptococcus suis strains isolated in France

Manon Dechêne-Tempier , Eric Jouy , Virginie Libante , Stéphanie Bougeard , Sophie Payot et al.

5th International Workshop on Streptococcus suis, Jun 2023, Bangkok / Thailand, Thailand

Communication dans un congrès hal-04232467v1

MBPCA-OS: an exploratory multiblock method for variables of different measurement levels. Application to study the immune response to SARS-CoV-2 infection and vaccination

Martin Pariès , Evelyne Vigneau , Adeline Huneau , Olivier Lantz , Stéphanie Bougeard

CARME (Correspondence Analysis and Related Methods), Sep 2023, Bonn, Germany

Communication dans un congrès anses-05040102v1

Multiblock analysis of mixed data with Optimal Scaling. Application in epidemiology.

Martin Pariès , Evelyne Vigneau , Stéphanie Bougeard

24th International Conference on Computational Statistics (COMPSTAT2022), University of Bologna, Italy, Aug 2022, Bologna (ITALY), France

Communication dans un congrès hal-05470179v1

Control of Salmonella in Powdered Infant Formula

Pauline Kooh , Moez Sanaa , Mickaël Boni , Stéphanie Bougeard , Bernard Caron et al.

International Symposium Salmonella and Salmonellosis, Jun 2022, Saint-Malo, France. pp.90

Communication dans un congrès hal-03845650v1

Relationships between intensity, Just-About-Right and liking variables using PLS-PM approach

Evelyne Vigneau , Martin Paries , Stéphanie Bougeard

AgroStat 2022, Société Française de Statistique (SFdS), Jun 2022, Lyon, France

Communication dans un congrès hal-05469463v1

Combined-information criterion for clusterwise elastic-net regression. Application to omic data

Stéphanie Bougeard , Xavier Bry , Thomas Verron , Ndèye Niang

8th Channel Network Conference, Cnam, Apr 2021, Paris, France

Communication dans un congrès hal-03541298v1

Component-based method for mixed data. Application in biology

Martin Pariès , Evelyne Vigneau , Stéphanie Bougeard

19th Conference of the Applied Stochastic Models and Data Analysis International Society, ASMDA2021, Jun 2021, Virtual conference (Covid), Greece

Communication dans un congrès hal-05473628v1

Multivariate analysis of Just-About-Right scale data with optimal scaling

Martin Pariès , Stéphanie Bougeard , Evelyne Vigneau

AgroStat 2021, Société Française de Statistique (SFdS), Sep 2021, Virtual conference (Covid), France

Communication dans un congrès hal-05473663v1

Antigenic cartography sheds new light on infectious bursal disease virus diversity

Liliana L Cubas-Gaona , Céline Courtillon , François‐xavier Briand , Stéphanie Bougeard , Edouard Hirchaud et al.

Avian infectious diseases 2021, British microbiology society, Sep 2021, Pirbright, United Kingdom

Communication dans un congrès hal-04738984v1

Apparition et sélection de variants d'un avibirnavirus soumis à diverses pressions de sélection lors de culture ex vivo basée sur des lymphocytes B aviaires

Liliana L Cubas-Gaona , Alexandre Flageul , Céline Courtillon , François‐xavier Briand , Maud Contrant et al.

XXIIIèmes Journées Francophones de Virologie, société française de virologie, Apr 2021, Montpellier, France

Communication dans un congrès hal-04738985v1
Deposit thumbnail

A new tool for multi-block PLS discriminant analysis: application to metabolomic data in systems epidemiology

Marion Brandolini-Bunlon , Mélanie Pétéra , Pierrette Gaudreau , Blandine Comte , Stéphanie Bougeard et al.

Conférence Chimiométrie 2020, Jan 2020, Liège, Belgium

Communication dans un congrès hal-02790379v1
Deposit thumbnail

A new tool for multi-block PLS discriminant analysis of metabolomic data: application to systems epidemiology

Marion Brandolini-Bunlon , Mélanie Pétéra , Pierrette Gaudreau , Blandine Comte , Stephanie Bougeard et al.

12. Journées Scientifiques du Réseau Francophone de Métabolomique et Fluxomique RFMF, May 2019, Clermont-Ferrand, France

Communication dans un congrès hal-02154660v1
Deposit thumbnail

Clusterwise multiblock PLS

Ndèye Niang , Stéphanie Bougeard , Gilbert Saporta

SFC 2018, Sep 2018, Paris, France

Communication dans un congrès hal-02471608v1

Current multiblock methods: competition or complementarity? A comparative study in a unified framework

Stéphanie Bougeard , Ndeye Niang Keita , Thomas Verron , Xavier Bry

Agrostat 2018, Mar 2018, Marseille, France

Communication dans un congrès hal-02065531v1

Quantifier, expliquer et réduire l’usage des antibiotiques en élevage porcin en Europe : bilan du projet MINAPIG

Lucie Collineau , Stéphanie Bougeard , Stéphane Krebs , Claire Chauvin , Catherine Belloc

50. Journées de la Recherche Porcine, Feb 2018, Paris, France

Communication dans un congrès hal-02734654v1
Deposit thumbnail

Clusterwise Sparse PLS

Stéphanie Bougeard , Ndeye Niang-Keita , Cristian Preda , Gilbert Saporta

PLS'17, Jun 2017, Macao, Macau SAR China

Communication dans un congrès hal-02475001v1

Regularized clusterwise multiblock regression

Stéphanie Bougeard , Ndèye Niang , Gilbert Saporta

Compstat 2016, Aug 2016, Oviedo, Spain

Communication dans un congrès hal-02500591v1

Some Sparse Methods for High Dimensional Data

Gilbert Saporta , Anne Bernard , Stéphanie Bougeard , Ndèye Niang , Cristian Preda

H2DM International Workshop on High Dimensional Data Mining, Jun 2016, Naples, Italy

Communication dans un congrès hal-02500643v1
Deposit thumbnail

Prédiction en régression clusterwise PLS

Ndèye Niang , Stéphanie Bougeard , Gilbert Saporta

48 èmes Journées de Statistique, May 2016, Montpellier, France

Communication dans un congrès hal-02500605v1

Les méthodes « clusterwise » : principes et applications

Gilbert Saporta , Stéphanie Bougeard , Ndeye Niang-Keita

XXII èmes rencontres de la Société Francophone de Classification, Sep 2015, Nantes, France

Communication dans un congrès hal-02507509v1

Clusterwise multiblock PLS

Ndeye Niang-Keita , Stéphanie Bougeard , Gilbert Saporta , Hervé Abdi

CARME 2015: Correspondence Analysis and Related Methods, Sep 2015, Napoli, Italy

Communication dans un congrès hal-02507449v1

Clusterwise multiblock PLS regression

Ndeye Niang-Keita , Stéphanie Bougeard , Gilbert Saporta

CFE-CMStats, Dec 2015, London, United Kingdom

Communication dans un congrès hal-02507429v1
Deposit thumbnail

Analyse de (K+1) tableaux avec le logiciel ade4. Application en épidémiologie.

Stéphanie Bougeard , Stéphane Dray

1ères Rencontres R, Jul 2012, Bordeaux, France

Communication dans un congrès hal-00717559v1
Deposit thumbnail

Etudes des lésions pulmonaires chez le porc : una analyse symbolique sur des concepts issus de l'approche classique

Christelle Fablet , Carole Toque , Stéphanie Bougeard , Edwin Diday

42èmes Journées de Statistique, 2010, Marseille, France, France

Communication dans un congrès inria-00494799v1
Deposit thumbnail

ACPVI multibloc qualitative. Application en épidémiologie vétérinaire.

Stéphanie Bougeard , El Mostafa Qannari , Christelle Fablet

41èmes Journées de Statistique, SFdS, Bordeaux, 2009, Bordeaux, France, France

Communication dans un congrès inria-00386614v1
Deposit thumbnail

Acquisition de l'immunité passive chez des porcelets issus de truies Exemptes d'Organismes Pathogènes Spécifiques (EOPS)

Roland Cariolet , Isabelle P. Oswald , Gérald Le Diguerher , Stéphanie Bougeard , Anne Marie Cossalter et al.

39. Journées de la Recherche Porcine, Feb 2007, Paris, France

Communication dans un congrès hal-02756742v1
Deposit thumbnail

Investigating the role of environmental factors in the French highly pathogenic avian influenza epizootic in 2022-2023

Maryem Ben Salem , Mathieu Andraud , Stéphanie Bougeard , Virginie Allain , Morgane Salines et al.

Frontiers in Veterinary Science, 2025, 12, ⟨10.3389/fvets.2025.1541019⟩

Article dans une revue anses-05111396v1
Deposit thumbnail

The clinical value and most informative threshold of polygenic risk score in the Quebec City Case-Control Asthma Cohort

Martin Pariès , Stéphanie Bougeard , Aida Eslami , Zhonglin Li , Michel Laviolette et al.

BMC Pulmonary Medicine, 2025, 25 (1), pp.21. ⟨10.1186/s12890-025-03486-3⟩

Article dans une revue anses-04982026v1
Deposit thumbnail

Pan-immune system, mobilome and resistome in Streptococcus suis

Manon Dechêne-Tempier , Stéphanie Bougeard , Valentin Loux , Hélène Chiapello , Virginie Libante et al.

Microbial Genomics, 2025, 11 (9), pp.001521. ⟨10.1099/mgen.0.001521⟩

Article dans une revue hal-05289975v1

PRRS management by European swine veterinarians: a descriptive insight into practices and profiles

Charlotte Teixeira Costa , Arnaud Lebret , Stéphanie Bougeard , Nicolas Rose

Porcine health management, 2025, 11 (1), pp.55. ⟨10.1186/s40813-025-00467-0⟩

Article dans une revue anses-05387651v1

Multiblock Analysis of Risk Factors and Management Areas of Calf Mortality in Large-Scale Dairy Herds

Dagni-Alice Viidu , Triin Rilanto , Stéphanie Bougeard , Tanel Kaart , Kerli Mõtus

Animals, 2025, 15 (19), pp.2780. ⟨10.3390/ani15192780⟩

Article dans une revue anses-05354022v1
Deposit thumbnail

A retrospective multivariate case-control approach to investigate factors influencing the sanitary quality of raw milk cheeses

Alisia Chiado Rana , Géraldine Cazeau , Stéphanie Bougeard , Kevin Bethune , Vincent Chochois et al.

Applied Food Research, 2024, 4 (2), pp.100617. ⟨10.1016/j.afres.2024.100617⟩

Article dans une revue anses-04816878v1
Deposit thumbnail

Application of multiblock analysis to identify key areas and risk factors for dairy cow persistence

Kerli Mõtus , Dagni-Alice Viidu , Triin Rilanto , Tarmo Niine , Toomas Orro et al.

Preventive Veterinary Medicine, 2024, 222, pp.106081. ⟨10.1016/j.prevetmed.2023.106081⟩

Article dans une revue anses-04416135v1
Deposit thumbnail

Virulence genes, resistome and mobilome of Streptococcus suis strains isolated in France

Manon Dechêne-Tempier , Claire de Boisséson , Pierrick Lucas , Stéphanie Bougeard , Virginie Libante et al.

Microbial Genomics, 2024, 10 (3), pp.001224. ⟨10.1099/mgen.0.001224⟩

Article dans une revue hal-04528772v1
Deposit thumbnail

Distribution of infectious and parasitic agents among three sentinel bee species across European agricultural landscapes

Aurélie Babin , Frank Schurr , Sabine Delannoy , Patrick Fach , Minh Huyen Ton Nu Nguyet et al.

Scientific Reports, 2024, 14 (1), pp.3524. ⟨10.1038/s41598-024-53357-w⟩

Article dans une revue hal-04481521v1
Deposit thumbnail

Novel indices reveal that pollinator exposure to pesticides varies across biological compartments and crop surroundings

Marion Laurent , Stéphanie Bougeard , Lucile Caradec , Florence Ghestem , Matthias Albrecht et al.

Science of the Total Environment, 2024, 927, pp.172118. ⟨10.1016/j.scitotenv.2024.172118⟩

Article dans une revue hal-04540908v1
Deposit thumbnail

Benchmarking multiblock methods with canonical factorization

Stéphanie Bougeard , Caroline Peltier , Benoît Jaillais , Jean-Claude Boulet , Mohamed Hanafi

Chemometrics and Intelligent Laboratory Systems, 2024, 254, pp.105240. ⟨10.1016/j.chemolab.2024.105240⟩

Article dans une revue hal-04945817v1
Deposit thumbnail

Polygenic inheritance and its interplay with smoking history in predicting lung cancer diagnosis: a French-Canadian case-control cohort

Véronique Boumtje , Hasanga D Manikpurage , Zhonglin Li , Nathalie Gaudreault , Victoria Saavedra Armero et al.

EBioMedicine, 2024, 106, pp.105234. ⟨10.1016/j.ebiom.2024.105234⟩

Article dans une revue anses-04678882v1

MBPCA-OS: an exploratory multiblock method for variables of different measurement levels. Application to study the immune response to SARS-CoV-2 infection and vaccination

Martin Pariès , Evelyne Vigneau , Adeline Huneau , Olivier Lantz , Stéphanie Bougeard

The international journal of biostatistics, 2023, ⟨10.1515/ijb-2023-0062⟩

Article dans une revue anses-04661219v1
Deposit thumbnail

Study of the effect of administration of narasin or antibiotics on in vivo selection of a narasin- and multidrug-resistant Enterococcus cecorum strain

Jeanne Laurentie , Gwenaelle Mourand , Eric Jouy , Stéphanie Bougeard , Alassane Keita et al.

Veterinary Microbiology, 2023, 282, pp. 109757. ⟨10.1016/j.vetmic.2023.109757⟩

Article dans une revue hal-04083477v1

Prediction model for multiblock data with or without intermediate blocks. Estimation by PLS Path Modeling

Stéphanie Bougeard , Pasquale Dolce , Véronique Cariou , Mohamed Hanafi

Chemometrics and Intelligent Laboratory Systems, 2023, 243, pp.105016. ⟨10.1016/j.chemolab.2023.105016⟩

Article dans une revue anses-04350825v1
Deposit thumbnail

Building composite indices in the age of big data – Application to honey bee exposure to infectious and parasitic agents

Minh Huyen Ton Nu Nguyet , Stéphanie Bougeard , Aurélie Babin , Eric Dubois , Christine Druesne et al.

Heliyon, 2023, 9 (4), pp.e15244. ⟨10.1016/j.heliyon.2023.e15244⟩

Article dans une revue anses-04068240v1
Deposit thumbnail

Application of Machine Learning Prediction of Individual SARS-CoV-2 Vaccination and Infection Status to the French Serosurveillance Survey From March 2020 to 2022: Cross-Sectional Study

Stéphanie Bougeard , Adeline Huneau-Salaun , Mikael Attia , Jean-Baptiste Richard , Caroline Demeret et al.

JMIR Public Health and Surveillance, 2023, 9, pp.e46898. ⟨10.2196/46898⟩

Article dans une revue anses-04395611v1
Deposit thumbnail

Antimicrobial resistance profiles of Streptococcus suis isolated from pigs, wild boars, and humans in France between 1994 and 2020

Manon Dechêne-Tempier , Eric Jouy , Marie-Hélène Bayon-Auboyer , Stéphanie Bougeard , Claire Chauvin et al.

Journal of Clinical Microbiology, 2023, 61 (9), pp.e0016423. ⟨10.1128/jcm.00164-23⟩

Article dans une revue anses-04228454v1
Deposit thumbnail

Monophasic Variant of Salmonella Typhimurium Infection Affects the Serum Metabolome in Swine

Guillaume Larivière-Gauthier , Annaëlle Kerouanton , Sophie Mompelat , Stéphanie Bougeard , Martine Denis et al.

Microorganisms, 2023, 11 (10), pp.2565. ⟨10.3390/microorganisms11102565⟩

Article dans une revue hal-04258691v1
Deposit thumbnail

Controlled Experimental Infection in Pigs with a Strain of Yersinia enterocolitica Harboring Genetic Markers for Human Pathogenicity: Colonization and Stability

Emilie Esnault , Alicia Rouaud , Annie Labbé , Catherine Houdayer , Yann Bailly et al.

Infection and Immunity, 2023, 91 (7), pp.e0015723. ⟨10.1128/iai.00157-23⟩

Article dans une revue anses-04228409v1
Deposit thumbnail

High antigenic diversity of serotype 1 infectious bursal disease virus revealed by antigenic cartography

Liliana L Cubas-Gaona , Céline Courtillon , Francois-Xavier Briand , Higor Cotta , Stephanie Bougeard et al.

Virus Research, 2023, 323, pp.198999. ⟨10.1016/j.virusres.2022.198999⟩

Article dans une revue anses-03966233v1

Clusterwise elastic-net regression based on a combined information criterion

Xavier Bry , Ndèye Niang , Thomas Verron , Stéphanie Bougeard

Advances in Data Analysis and Classification, 2023, 17, pp.75-107. ⟨10.1007/s11634-021-00489-w⟩

Article dans une revue hal-03541125v1
Deposit thumbnail

Infectious bursal disease virus: predicting viral pathotype using machine learning models focused on early changes in total blood cell counts

Annonciade Molinet , Céline Courtillon , Stéphanie Bougeard , Alassane Keita , Béatrice Grasland et al.

Veterinary Research, 2023, 54, pp.101. ⟨10.1186/s13567-023-01222-5⟩

Article dans une revue hal-04272844v1
Deposit thumbnail

Efficacy of passive immunization in broiler chicks via an inactivated Escherichia coli autogenous vaccine administered to broiler breeder hens

Alassane Keita , Laetitia Le Devendec , Michel Amelot , Julie Puterflam , Camille Lucas et al.

Avian Pathology, 2022, 51 (5), pp.445-456. ⟨10.1080/03079457.2022.2084362⟩

Article dans une revue hal-03700012v1
Deposit thumbnail

Avian metapneumovirus: A five-plex digital droplet RT-PCR method for identification of subgroups A, B, C, and D

Evelyne Lemaitre , Stéphanie Bougeard , Chantal Allée , Nicolas Eterradossi , Céline Courtillon et al.

Frontiers in Veterinary Science, 2022, 9, pp.1058294. ⟨10.3389/fvets.2022.1058294⟩

Article dans une revue anses-03965626v1
Deposit thumbnail

Colisée - Maîtrise de la colibacillose du poulet : quelles pistes d’action ?

Julie Puterflam , Rozenn Souillard , Loïc Balaine , P. Galliot , Pierrick Lucas et al.

Innovations Agronomiques, 2022, 85, pp.83-92. ⟨10.17180/ciag-2022-vol85-art07⟩

Article dans une revue hal-03727784v1

Blood B Cell Depletion Reflects Immunosuppression Induced by Live-Attenuated Infectious Bursal Disease Vaccines

Céline Courtillon , Chantal Allée , Michel Amelot , Alassane Keita , Stéphanie Bougeard et al.

Frontiers in Veterinary Science, 2022, 9, pp.871549. ⟨10.3389/fvets.2022.871549⟩

Article dans une revue anses-03798831v1
Deposit thumbnail

Description and validation of a new set of PCR markers predictive of avian pathogenic Escherichia coli virulence

Camille Lucas , Sabine Delannoy , Catherine Schouler , Rozenn Souillard , Laetitia Le Devendec et al.

Veterinary Microbiology, 2022, 273, 7 p. ⟨10.1016/j.vetmic.2022.109530⟩

Article dans une revue hal-03768115v1

Multivariate analysis of Just-About-Right data with optimal scaling approach

Martin Pariès , Stéphanie Bougeard , Evelyne Vigneau

Food Quality and Preference, 2022, 102, pp.104681. ⟨10.1016/j.foodqual.2022.104681⟩

Article dans une revue anses-03967913v1
Deposit thumbnail

Mortality of marine mussels Mytilus edulis and M. galloprovincialis : systematic literature review of risk factors and recommendations for future research

Coralie Lupo , Stephanie Bougeard , Véronique Le Bihan , Jean Louis Blin , Gwenhael Allain et al.

Reviews in Aquaculture, 2021, 13 (1), pp.504-536. ⟨10.1111/raq.12484⟩

Article dans une revue hal-03411037v1
Deposit thumbnail

Diversity of Escherichia coli strains isolated from day-old broiler chicks, their environment and colibacillosis lesions in 80 flocks in France

Sabine Delannoy , Catherine Schouler , Rozenn Souillard , Léna Yousfi , Laetitia Le Devendec et al.

Veterinary Microbiology, 2021, 252, pp.108923. ⟨10.1016/j.vetmic.2020.108923⟩

Article dans une revue hal-03107169v1
Deposit thumbnail

Impact of Escherichia coli probiotic strains ED1a and Nissle 1917 on the excretion and gut carriage of extended-spectrum beta-lactamase-producing E. coli in pigs

Gwénaëlle Mourand , Frédéric Paboeuf , Pauline Grippon , Pierrick Lucas , Stéphanie Bougeard et al.

Veterinary and Animal Science, 2021, 14, pp.100217. ⟨10.1016/j.vas.2021.100217⟩

Article dans une revue anses-04423941v1
Deposit thumbnail

Do Rubber Floor Mats Prevent Lameness in Gestating Sows Housed in Large Groups? A Field Experiment on Three Commercial Farms in France

Adeline Huneau-Salaün , Stéphanie Bougeard , Loïc Balaine , Florent Eono , Éric Eveno et al.

Animals, 2021, 11 (11), pp.3160. ⟨10.3390/ani11113160⟩

Article dans une revue anses-03462283v1
Deposit thumbnail

Spatiotemporal clustering and Random Forest models to identify risk factors of African swine fever outbreak in Romania in 2018–2019

Mathieu Andraud , Stéphanie Bougeard , Theodora Chesnoiu , Nicolas Rose

Scientific Reports, 2021, 11 (1), pp.2098. ⟨10.1038/s41598-021-81329-x⟩

Article dans une revue anses-03455221v1
Deposit thumbnail

Genome Evolution of Two Genetically Homogeneous Infectious Bursal Disease Virus Strains During Passages in vitro and ex vivo in the Presence of a Mutagenic Nucleoside Analog

Liliana Cubas-Gaona , Alexandre Flageul , Céline Courtillon , Francois-Xavier Briand , Maud Contrant et al.

Frontiers in Microbiology, 2021, 12, pp.678563. ⟨10.3389/fmicb.2021.678563⟩

Article dans une revue anses-03455514v1
Deposit thumbnail

DUGMO: tool for the detection of unknown genetically modified organisms with high-throughput sequencing data for pure bacterial samples

Julie Hurel , Sophie S. Schbath , Stéphanie Bougeard , Mathieu Rolland , Mauro Petrillo et al.

BMC Bioinformatics, 2020, 21 (1), ⟨10.1186/s12859-020-03611-5⟩

Article dans une revue hal-02914869v1

Multi-block PLS discriminant analysis for the joint analysis of metabolomic and epidemiological data

Marion Brandolini-Bunlon , Mélanie Pétéra , P. Gaudreau , Blandine Comte , S. Bougeard et al.

Metabolomics, 2019, 15 (10), ⟨10.1007/s11306-019-1598-y⟩

Article dans une revue hal-02308942v1
Deposit thumbnail

Régression multibloc sur classes latentes. Application à l’usage d’antibiotiques en élevages de lapins

Stéphanie Bougeard , Claire Chauvin , Gilbert Saporta , Ndèye Niang

Epidémiologie et Santé Animale, 2019, 76, pp.43-53

Article dans une revue hal-02919886v1
Deposit thumbnail

Clusterwise analysis for multiblock component methods

Stéphanie Bougeard , Hervé Abdi , Gilbert Saporta , Ndèye Niang

Advances in Data Analysis and Classification, 2018, 12 (2), pp.285-313. ⟨10.1007/s11634-017-0296-8⟩

Article dans une revue hal-02470765v1
Deposit thumbnail

A New Micro-Batch Approach for Partial Least Square Clusterwise Regression

Gaël Beck , Hanane Azzag , Stéphanie Bougeard , Mustapha Lebbah , Ndèye Niang

Procedia Computer Science, 2018, 144, pp.239-250. ⟨10.1016/j.procs.2018.10.525⟩

Article dans une revue hal-02471601v1
Deposit thumbnail

Application of multiblock modelling to identify key drivers for antimicrobial use in pig production in four European countries

Lucie Collineau , Stéphanie Bougeard , Annette Backhans , Jeroen Dewulf , Ulf Emanuelson et al.

Epidemiology and Infection, 2018, 146 (08), pp.1003-1014. ⟨10.1017/S0950268818000742⟩

Article dans une revue hal-02621581v1

Prediction for regularized clusterwise multiblock regression

Stéphanie Bougeard , Véronique Cariou , Gilbert Saporta , Ndèye Niang

Applied Stochastic Models in Business and Industry, 2018, 34 (6), pp.852-867. ⟨10.1002/asmb.2335⟩

Article dans une revue hal-02470028v1
Deposit thumbnail

Supervised Multiblock Analysis in R with the ade4 Package

Stéphanie Bougeard , Stéphane Dray

Journal of Statistical Software, 2018, 86 (1), ⟨10.18637/jss.v086.i01⟩

Article dans une revue hal-02325703v1

Current multiblock methods: competition or complementarity? A comparative study in a unified framework

Stéphanie Bougeard , Ndeye Niang Keita , Xavier Bry , Thomas Verron

Chemometrics and Intelligent Laboratory Systems, 2018, 182, pp.131-148. ⟨10.1016/j.chemolab.2018.09.003⟩

Article dans une revue hal-01962769v1
Deposit thumbnail

A pan-European epidemiological study reveals honey bee colony survival depends on beekeeper education and disease control

Antoine Jacques , Marion Laurent , Magali Ribière-Chabert , Mathilde Saussac , Stéphanie Bougeard et al.

PLoS ONE, 2017, 12 (3), pp.e0172591. ⟨10.1371/journal.pone.0172591⟩

Article dans une revue anses-03793136v1
Deposit thumbnail

Campylobacter coli in Organic and Conventional Pig Production in France and Sweden: Prevalence and Antimicrobial Resistance

Isabelle Kempf , Annaelle Kerouanton , Stéphanie Bougeard , Bérengère Nagard , Valérie Rose et al.

Frontiers in Microbiology, 2017, 8, ⟨10.3389/fmicb.2017.00955⟩

Article dans une revue hal-04258469v1

Risk indicators affecting honeybee colony survival in Europe: one year of surveillance

Marie-Pierre Chauzat , Antoine Jacques , Marion Laurent , Stéphanie Bougeard , Pascal Hendrikx et al.

Apidologie, 2016, 47 (3), pp.348-378. ⟨10.1007/s13592-016-0440-z⟩

Article dans une revue anses-03793139v1
Deposit thumbnail

Risk indicators affecting honeybee colony survival in Europe: one year of surveillance

Marie-Pierre Chauzat , Antoine Jacques , Marion Laurent , Stéphanie Bougeard , Pascal Hendrikx et al.

Apidologie, 2016, 47 (3), pp.348-378. ⟨10.1007/s13592-016-0440-z⟩

Article dans une revue hal-01532482v1

Impact of colistin sulfate treatment of broilers on the presence of resistant bacteria and resistance genes in stored or composted manure

Laetitia Le Devendec , Gwénaëlle Mourand , Stéphanie Bougeard , Julien Léaustic , Eric Jouy et al.

Veterinary Microbiology, 2016, 194, pp.98-106. ⟨10.1016/j.vetmic.2015.11.012⟩

Article dans une revue istex hal-02488665v1

Algorithms for multi-group PLS

Aïda Eslami , El Mostafa Qannari , Achim Kohler , Stéphanie Bougeard

Journal of Chemometrics, 2014, 28 (3), pp.192-201. ⟨10.1002/cem.2593⟩

Article dans une revue istex hal-02634546v1

Multiblock modeling for complex preference study. Application to European preferences for smoked salmon

Stephanie Bougeard , Mireille Cardinal

Food Quality and Preference, 2014, 32 (Part A), pp.56-64. ⟨10.1016/j.foodqual.2013.06.002⟩

Article dans une revue hal-04499517v1

Multivariate analysis of multiblock and multigroup data

A. Eslami , E. M. Qannari , A. Kohler , S. Bougeard

Chemometrics and Intelligent Laboratory Systems, 2014, 133, pp.63-69. ⟨10.1016/j.chemolab.2014.01.016⟩

Article dans une revue hal-05013509v1

General overview of methods of analysis of multi-group datasets

Aida Eslami , Achim Kohler , El Mostafa Qannari , Stéphanie Bougeard

Revue des Nouvelles Technologies de l'Information, 2013, Advances in Theory and Applications of High Dimensional and Symbolic Data Analysis, RNTI-E-25, pp.108-123

Article dans une revue hal-05014438v1
Deposit thumbnail

Analyses factorielles de données structurées en groupes d'individus

Aida Eslami , El Mostafa Qannari , Achim Kohler , Stéphanie Bougeard

Journal de la Société Française de Statistique, 2013

Article dans une revue hal-05014378v1

Multiblock redundancy analysis: interpretation tools and application in epidemiology

Stéphanie Bougeard , El Mostafa Qannari , Nicolas Rose

Journal of Chemometrics, 2011, 25 (9), pp.467-475. ⟨10.1002/cem.1392⟩

Article dans une revue hal-05017104v1

Campylobacter from sows in farrow-to-finish pig farms: Risk indicators and genetic diversity

Martine Denis , Emmanuelle Henrique , Bérengère Chidaine , Annie Tircot , Stéphanie Bougeard et al.

Veterinary Microbiology, 2011, 154 (1-2), pp.163-170. ⟨10.1016/j.vetmic.2011.07.001⟩

Article dans une revue istex hal-04258588v1
Deposit thumbnail

Multiblock redundancy analysis from a user's perspective. Application in veterinary epidemiology.

Stéphanie Bougeard , El Mostafa Qannari , Coralie Lupo , Claire Chauvin

Electronic Journal of Applied Statistical Analysis, 2011, 4 (2), ⟨10.1285/i20705948v4n2p203⟩

Article dans une revue hal-05017030v1
Deposit thumbnail

Replication efficiency of rolling-circle replicon-based plasmids derived from porcine circovirus 2 in eukaryotic cells.

Florence Faurez , Daniel Dory , Aurélie Henry , Stéphanie Bougeard , André Jestin

Journal of Virological Methods, 2010, 165 (1), pp.27-35. ⟨10.1016/j.jviromet.2009.12.013⟩

Article dans une revue hal-00493407v1

Detection of Listeria monocytogenes in raw and pasteurized liquid whole eggs and characterization by PFGE.

Katell Rivoal , Stéphane Quéguiner , Evelyne Boscher , Stéphanie Bougeard , Gwennola Ermel et al.

International Journal of Food Microbiology, 2010, 138 (1-2), pp.56-62. ⟨10.1016/j.ijfoodmicro.2010.01.013⟩

Article dans une revue istex hal-00473747v1

Temperature sensitivity on growth and/or replication of H1N1, H1N2 and H3N2 influenza A viruses isolated from pigs and birds in mammalian cells.

Pascale Massin , Gaëlle Kuntz-Simon , Cyril Barbezange , Céline Deblanc , Aurélie Oger et al.

Veterinary Microbiology, 2009, epub ahead of print. ⟨10.1016/j.vetmic.2009.10.012⟩

Article dans une revue istex pasteur-00457734v1

Influence of pesticide residues on honey bee (Hymenoptera: Apidae) colony health in France.

Marie-Pierre Chauzat , Patrice Carpentier , Anne-Claire Martel , Stéphanie Bougeard , Nicolas Cougoule et al.

Environmental Entomology, 2009, 38 (3), pp.514-23. ⟨10.1603/022.038.0302⟩

Article dans une revue hal-00417646v1
Deposit thumbnail

Impact of deoxynivalenol on the intestinal microflora of pigs

Yann Wache , Charlotte Valat , Gilbert Postollec , Stephanie Bougeard , Christine Burel et al.

International Journal of Molecular Sciences, 2008, 10 (1), pp.1-17. ⟨10.3390/ijms10010001⟩

Article dans une revue hal-01985348v1

Multiblock latent root regression. Application to epidemiological data

Stéphanie Bougeard , Mohamed Hanafi , El Mostafa Qannari

Computational Statistics, 2007, 22 (2), pp.209-222. ⟨10.1007/s00180-007-0036-1⟩

Article dans une revue istex hal-04506046v1
Deposit thumbnail

ACPVI multibloc. Application en épidémiologie animale

Stéphanie Bougeard , Mohamed Hanafi , El Mostafa Qannari

Journal de la Société Française de Statistique, 2007, 148 (4), pp.78-94

Article dans une revue hal-04506070v1
Deposit thumbnail

Bacterial and farm management risk factors in raw milk cheese production

Alisia Chiadò Rana , Géraldine Cazeau , Stéphanie Bougeard , Kevin Bethune , Vincent Chochois et al.

Conference Society for Veterinary Epidemiology and Preventive Medicine (SVEPM), Mar 2025, Berlin, Germany. 86, 2018

Poster de conférence anses-05151336v1

Phenotypic and genotypic characterization of antimicrobial resistance in Streptococcus suis strains isolated in France, under a “One Health” approach.

Manon Dechêne-Tempier , Virginie Libante , Eric Jouy , Claire de Boisséson , Pierrick Lucas et al.

The One Health challenges to tackle infectious diseases, Jun 2024, Saint-Brieuc, France, France

Poster de conférence hal-05286331v1

Factors contributing to the prevalence of Integrative and Conjugative or Mobilizable Elements carrying antimicrobial resistance genes in Streptococcus suis

Stéphanie Bougeard , Manon Dechêne-Tempier , Valentin Loux , Hélène Chiapello , Virginie Libante et al.

5th International Workshop on Streptococcus suis, Jun 2023, Bangkok / Thailand, Thailand

Poster de conférence hal-04232466v1

Improvement of maldi-tof for the identification of Aeromonas salmonicida and Aeromonas bestiarum : two important fish pathogen

Jean-Sébastien Py , Maureen Feucherolles , Yann Vanrobaeys , Eric Jouy , Laetitia Le Devendec et al.

13. International Symposium on Aeromonas and Plesiomonas (ISAP), Jun 2023, Wroclaw, Poland. 2023

Poster de conférence anses-04168208v1

Control of Salmonella and Cronobacter spp. in powdered infant formula

Pauline Kooh , Moez Sanaa , M. Boni , Stephanie Bougeard , Bernard Caron et al.

FoodMicro2022, Aug 2022, Athene, Greece. , 2022

Poster de conférence anses-03903055v1

Les facteurs déclenchants de la colibacillose du poulet de chair : étude épidémiologique dans 80 élevages en France

Julie Puterflam , Pascal Galliot , Loïc Balaine , Isabelle Kempf , Laetitia Le Devendec et al.

14èmes Journées de la Recherche Avicole et des Palmipèdes à Foie Gras, Mar 2022, Tours, France

Poster de conférence hal-03775530v1

Immunisation passive des poussins par l'administration d'un autovaccin aux poules reproductrices

Alassane Keita , Laetitia Le Devendec , Michel Amelot , Julie Puterflam , Camille Lucas et al.

14èmes Journées de la Recherche Avicole et des Palmipèdes à Foie Gras, Mar 2022, Tours (France), France. 2022

Poster de conférence anses-04082645v1
Deposit thumbnail

Detection of unknown genetically modified organisms (GMO) by statistical analysis of high throughput sequencing data

Julie Hurel , Mathieu Roland , Sophie Schbath , Stéphanie Bougeard , Mauro Petrillo et al.

JOBIM 2019, Jul 2019, Nantes, France. , 2019

Poster de conférence hal-02734732v1

Acquisition de l'immunité passive chez des porcelets issus de truies exemptes d'organismes pathogènes spécifiques "EOPS

R Cariolet , Isabelle P. Oswald , G Le Diguerher , S Bougeard , Anne Marie Cossalter et al.

Journées de la Recherche Porcine, 2007, France. pp.Inconnu, 2007

Poster de conférence hal-02815333v1