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Stéphanie Bougeard

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  • Laboratoire de Ploufragan-Plouzané-Niort [ANSES]
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Publications

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The clinical value and most informative threshold of polygenic risk score in the Quebec City Case-Control Asthma Cohort

Martin Pariès , Stéphanie Bougeard , Aida Eslami , Zhonglin Li , Michel Laviolette et al.
BMC Pulmonary Medicine, 2025, 25 (1), pp.21. ⟨10.1186/s12890-025-03486-3⟩
Article dans une revue anses-04982026 v1
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Investigating the role of environmental factors in the French highly pathogenic avian influenza epizootic in 2022-2023

Maryem Ben Salem , Mathieu Andraud , Stéphanie Bougeard , Virginie Allain , Morgane Salines et al.
Frontiers in Veterinary Science, 2025, 12, ⟨10.3389/fvets.2025.1541019⟩
Article dans une revue anses-05111396 v1
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Pan-immune system, mobilome and resistome in Streptococcus suis

Manon Dechêne-Tempier , Stéphanie Bougeard , Valentin Loux , Hélène Chiapello , Virginie Libante et al.
Microbial Genomics, 2025, 11 (9), pp.001521. ⟨10.1099/mgen.0.001521⟩
Article dans une revue hal-05289975 v1
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Polygenic inheritance and its interplay with smoking history in predicting lung cancer diagnosis: a French-Canadian case-control cohort

Véronique Boumtje , Hasanga D Manikpurage , Zhonglin Li , Nathalie Gaudreault , Victoria Saavedra Armero et al.
EBioMedicine, 2024, 106, pp.105234. ⟨10.1016/j.ebiom.2024.105234⟩
Article dans une revue anses-04678882 v1
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Application of multiblock analysis to identify key areas and risk factors for dairy cow persistence

Kerli Mõtus , Dagni-Alice Viidu , Triin Rilanto , Tarmo Niine , Toomas Orro et al.
Preventive Veterinary Medicine, 2024, 222, pp.106081. ⟨10.1016/j.prevetmed.2023.106081⟩
Article dans une revue anses-04416135 v1
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A retrospective multivariate case-control approach to investigate factors influencing the sanitary quality of raw milk cheeses

Alisia Chiado Rana , Géraldine Cazeau , Stéphanie Bougeard , Kevin Bethune , Vincent Chochois et al.
Applied Food Research, 2024, 4 (2), pp.100617. ⟨10.1016/j.afres.2024.100617⟩
Article dans une revue anses-04816878 v1
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Virulence genes, resistome and mobilome of Streptococcus suis strains isolated in France

Manon Dechêne-Tempier , Claire de Boisséson , Pierrick Lucas , Stéphanie Bougeard , Virginie Libante et al.
Microbial Genomics, 2024, 10 (3), pp.001224. ⟨10.1099/mgen.0.001224⟩
Article dans une revue hal-04528772 v1
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Novel indices reveal that pollinator exposure to pesticides varies across biological compartments and crop surroundings

Marion Laurent , Stéphanie Bougeard , Lucile Caradec , Florence Ghestem , Matthias Albrecht et al.
Science of the Total Environment, 2024, 927, pp.172118. ⟨10.1016/j.scitotenv.2024.172118⟩
Article dans une revue hal-04540908 v1
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Distribution of infectious and parasitic agents among three sentinel bee species across European agricultural landscapes

Aurélie Babin , Frank Schurr , Sabine Delannoy , Patrick Fach , Minh Huyen Ton Nu Nguyet et al.
Scientific Reports, 2024, 14 (1), pp.3524. ⟨10.1038/s41598-024-53357-w⟩
Article dans une revue hal-04481521 v1
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Benchmarking multiblock methods with canonical factorization

Stéphanie Bougeard , Caroline Peltier , Benoît Jaillais , Jean-Claude Boulet , Mohamed Hanafi
Chemometrics and Intelligent Laboratory Systems, 2024, 254, pp.105240. ⟨10.1016/j.chemolab.2024.105240⟩
Article dans une revue hal-04945817 v1
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Infectious bursal disease virus: predicting viral pathotype using machine learning models focused on early changes in total blood cell counts

Annonciade Molinet , Céline Courtillon , Stéphanie Bougeard , Alassane Keita , Béatrice Grasland et al.
Veterinary Research, 2023, 54, pp.101. ⟨10.1186/s13567-023-01222-5⟩
Article dans une revue hal-04272844 v1

MBPCA-OS: an exploratory multiblock method for variables of different measurement levels. Application to study the immune response to SARS-CoV-2 infection and vaccination

Martin Pariès , Evelyne Vigneau , Adeline Huneau , Olivier Lantz , Stéphanie Bougeard
The international journal of biostatistics, 2023, ⟨10.1515/ijb-2023-0062⟩
Article dans une revue anses-04661219 v1
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Study of the effect of administration of narasin or antibiotics on in vivo selection of a narasin- and multidrug-resistant Enterococcus cecorum strain

Jeanne Laurentie , Gwenaelle Mourand , Eric Jouy , Stéphanie Bougeard , Alassane Keita et al.
Veterinary Microbiology, 2023, 282, pp. 109757. ⟨10.1016/j.vetmic.2023.109757⟩
Article dans une revue hal-04083477 v1
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Antimicrobial resistance profiles of Streptococcus suis isolated from pigs, wild boars, and humans in France between 1994 and 2020

Manon Dechêne-Tempier , Eric Jouy , Marie-Hélène Bayon-Auboyer , Stéphanie Bougeard , Claire Chauvin et al.
Journal of Clinical Microbiology, 2023, 61 (9), pp.e0016423. ⟨10.1128/jcm.00164-23⟩
Article dans une revue anses-04228454 v1
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Building composite indices in the age of big data – Application to honey bee exposure to infectious and parasitic agents

Minh Huyen Ton Nu Nguyet , Stéphanie Bougeard , Aurélie Babin , Eric Dubois , Christine Druesne et al.
Heliyon, 2023, 9 (4), pp.e15244. ⟨10.1016/j.heliyon.2023.e15244⟩
Article dans une revue anses-04068240 v1
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Application of Machine Learning Prediction of Individual SARS-CoV-2 Vaccination and Infection Status to the French Serosurveillance Survey From March 2020 to 2022: Cross-Sectional Study

Stéphanie Bougeard , Adeline Huneau-Salaun , Mikael Attia , Jean-Baptiste Richard , Caroline Demeret et al.
JMIR Public Health and Surveillance, 2023, 9, pp.e46898. ⟨10.2196/46898⟩
Article dans une revue anses-04395611 v1

Prediction model for multiblock data with or without intermediate blocks. Estimation by PLS Path Modeling

Stéphanie Bougeard , Pasquale Dolce , Véronique Cariou , Mohamed Hanafi
Chemometrics and Intelligent Laboratory Systems, 2023, 243, pp.105016. ⟨10.1016/j.chemolab.2023.105016⟩
Article dans une revue anses-04350825 v1
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Monophasic Variant of Salmonella Typhimurium Infection Affects the Serum Metabolome in Swine

Guillaume Larivière-Gauthier , Annaëlle Kerouanton , Sophie Mompelat , Stéphanie Bougeard , Martine Denis et al.
Microorganisms, 2023, 11 (10), pp.2565. ⟨10.3390/microorganisms11102565⟩
Article dans une revue hal-04258691 v1
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Controlled Experimental Infection in Pigs with a Strain of Yersinia enterocolitica Harboring Genetic Markers for Human Pathogenicity: Colonization and Stability

Emilie Esnault , Alicia Rouaud , Annie Labbé , Catherine Houdayer , Yann Bailly et al.
Infection and Immunity, 2023, 91 (7), pp.e0015723. ⟨10.1128/iai.00157-23⟩
Article dans une revue anses-04228409 v1

Clusterwise elastic-net regression based on a combined information criterion

Xavier Bry , Ndèye Niang , Thomas Verron , Stéphanie Bougeard
Advances in Data Analysis and Classification, 2023, 17, pp.75-107. ⟨10.1007/s11634-021-00489-w⟩
Article dans une revue hal-03541125 v1
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High antigenic diversity of serotype 1 infectious bursal disease virus revealed by antigenic cartography

Liliana L Cubas-Gaona , Céline Courtillon , Francois-Xavier Briand , Higor Cotta , Stephanie Bougeard et al.
Virus Research, 2023, 323, pp.198999. ⟨10.1016/j.virusres.2022.198999⟩
Article dans une revue anses-03966233 v1
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Avian metapneumovirus: A five-plex digital droplet RT-PCR method for identification of subgroups A, B, C, and D

Evelyne Lemaitre , Stéphanie Bougeard , Chantal Allée , Nicolas Eterradossi , Céline Courtillon et al.
Frontiers in Veterinary Science, 2022, 9, pp.1058294. ⟨10.3389/fvets.2022.1058294⟩
Article dans une revue anses-03965626 v1
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Efficacy of passive immunization in broiler chicks via an inactivated Escherichia coli autogenous vaccine administered to broiler breeder hens

Alassane Keita , Laetitia Le Devendec , Michel Amelot , Julie Puterflam , Camille Lucas et al.
Avian Pathology, 2022, 51 (5), pp.445-456. ⟨10.1080/03079457.2022.2084362⟩
Article dans une revue hal-03700012 v1
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Colisée - Maîtrise de la colibacillose du poulet : quelles pistes d’action ?

Julie Puterflam , Rozenn Souillard , Loïc Balaine , P. Galliot , Pierrick Lucas et al.
Innovations Agronomiques, 2022, 85, pp.83-92. ⟨10.17180/ciag-2022-vol85-art07⟩
Article dans une revue hal-03727784 v1
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Description and validation of a new set of PCR markers predictive of avian pathogenic Escherichia coli virulence

Camille Lucas , Sabine Delannoy , Catherine Schouler , Rozenn Souillard , Laetitia Le Devendec et al.
Veterinary Microbiology, 2022, 273, 7 p. ⟨10.1016/j.vetmic.2022.109530⟩
Article dans une revue hal-03768115 v1

Multivariate analysis of Just-About-Right data with optimal scaling approach

Martin Pariès , Stéphanie Bougeard , Evelyne Vigneau
Food Quality and Preference, 2022, 102, pp.104681. ⟨10.1016/j.foodqual.2022.104681⟩
Article dans une revue anses-03967913 v1

Blood B Cell Depletion Reflects Immunosuppression Induced by Live-Attenuated Infectious Bursal Disease Vaccines

Céline Courtillon , Chantal Allée , Michel Amelot , Alassane Keita , Stéphanie Bougeard et al.
Frontiers in Veterinary Science, 2022, 9, pp.871549. ⟨10.3389/fvets.2022.871549⟩
Article dans une revue anses-03798831 v1
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Spatiotemporal clustering and Random Forest models to identify risk factors of African swine fever outbreak in Romania in 2018–2019

Mathieu Andraud , Stéphanie Bougeard , Theodora Chesnoiu , Nicolas Rose
Scientific Reports, 2021, 11 (1), pp.2098. ⟨10.1038/s41598-021-81329-x⟩
Article dans une revue anses-03455221 v1
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Do Rubber Floor Mats Prevent Lameness in Gestating Sows Housed in Large Groups? A Field Experiment on Three Commercial Farms in France

Adeline Huneau-Salaün , Stéphanie Bougeard , Loïc Balaine , Florent Eono , Éric Eveno et al.
Animals, 2021, 11 (11), pp.3160. ⟨10.3390/ani11113160⟩
Article dans une revue anses-03462283 v1
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Genome Evolution of Two Genetically Homogeneous Infectious Bursal Disease Virus Strains During Passages in vitro and ex vivo in the Presence of a Mutagenic Nucleoside Analog

Liliana Cubas-Gaona , Alexandre Flageul , Céline Courtillon , Francois-Xavier Briand , Maud Contrant et al.
Frontiers in Microbiology, 2021, 12, pp.678563. ⟨10.3389/fmicb.2021.678563⟩
Article dans une revue anses-03455514 v1
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Diversity of Escherichia coli strains isolated from day-old broiler chicks, their environment and colibacillosis lesions in 80 flocks in France

Sabine Delannoy , Catherine Schouler , Rozenn Souillard , Léna Yousfi , Laetitia Le Devendec et al.
Veterinary Microbiology, 2021, 252, pp.108923. ⟨10.1016/j.vetmic.2020.108923⟩
Article dans une revue hal-03107169 v1
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Mortality of marine mussels Mytilus edulis and M. galloprovincialis : systematic literature review of risk factors and recommendations for future research

Coralie Lupo , Stephanie Bougeard , Véronique Le Bihan , Jean Louis Blin , Gwenhael Allain et al.
Reviews in Aquaculture, 2021, 13 (1), pp.504-536. ⟨10.1111/raq.12484⟩
Article dans une revue hal-03411037 v1
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Impact of Escherichia coli probiotic strains ED1a and Nissle 1917 on the excretion and gut carriage of extended-spectrum beta-lactamase-producing E. coli in pigs

Gwénaëlle Mourand , Frédéric Paboeuf , Pauline Grippon , Pierrick Lucas , Stéphanie Bougeard et al.
Veterinary and Animal Science, 2021, 14, pp.100217. ⟨10.1016/j.vas.2021.100217⟩
Article dans une revue anses-04423941 v1
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DUGMO: tool for the detection of unknown genetically modified organisms with high-throughput sequencing data for pure bacterial samples

Julie Hurel , Sophie S. Schbath , Stéphanie Bougeard , Mathieu Rolland , Mauro Petrillo et al.
BMC Bioinformatics, 2020, 21 (1), ⟨10.1186/s12859-020-03611-5⟩
Article dans une revue hal-02914869 v1
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Régression multibloc sur classes latentes. Application à l’usage d’antibiotiques en élevages de lapins

Stéphanie Bougeard , Claire Chauvin , Gilbert Saporta , Ndèye Niang
Epidémiologie et Santé Animale, 2019, 76, pp.43-53
Article dans une revue hal-02919886 v1

Multi-block PLS discriminant analysis for the joint analysis of metabolomic and epidemiological data

Marion Brandolini-Bunlon , Mélanie Pétéra , P. Gaudreau , Blandine Comte , S. Bougeard et al.
Metabolomics, 2019, 15 (10), ⟨10.1007/s11306-019-1598-y⟩
Article dans une revue hal-02308942 v1

Prediction for regularized clusterwise multiblock regression

Stéphanie Bougeard , Véronique Cariou , Gilbert Saporta , Ndèye Niang
Applied Stochastic Models in Business and Industry, 2018, 34 (6), pp.852-867. ⟨10.1002/asmb.2335⟩
Article dans une revue hal-02470028 v1
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Application of multiblock modelling to identify key drivers for antimicrobial use in pig production in four European countries

Lucie Collineau , Stéphanie Bougeard , Annette Backhans , Jeroen Dewulf , Ulf Emanuelson et al.
Epidemiology and Infection, 2018, 146 (08), pp.1003-1014. ⟨10.1017/S0950268818000742⟩
Article dans une revue hal-02621581 v1
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Clusterwise analysis for multiblock component methods

Stéphanie Bougeard , Hervé Abdi , Gilbert Saporta , Ndèye Niang
Advances in Data Analysis and Classification, 2018, 12 (2), pp.285-313. ⟨10.1007/s11634-017-0296-8⟩
Article dans une revue hal-02470765 v1
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A New Micro-Batch Approach for Partial Least Square Clusterwise Regression

Gaël Beck , Hanane Azzag , Stéphanie Bougeard , Mustapha Lebbah , Ndèye Niang
Procedia Computer Science, 2018, 144, pp.239-250. ⟨10.1016/j.procs.2018.10.525⟩
Article dans une revue hal-02471601 v1

Current multiblock methods: competition or complementarity? A comparative study in a unified framework

Stéphanie Bougeard , Ndeye Niang Keita , Xavier Bry , Thomas Verron
Chemometrics and Intelligent Laboratory Systems, 2018, 182, pp.131-148. ⟨10.1016/j.chemolab.2018.09.003⟩
Article dans une revue hal-01962769 v1
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Supervised Multiblock Analysis in R with the ade4 Package

Stéphanie Bougeard , Stéphane Dray
Journal of Statistical Software, 2018, 86 (1), ⟨10.18637/jss.v086.i01⟩
Article dans une revue hal-02325703 v1
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Campylobacter coli in Organic and Conventional Pig Production in France and Sweden: Prevalence and Antimicrobial Resistance

Isabelle Kempf , Annaelle Kerouanton , Stéphanie Bougeard , Bérengère Nagard , Valérie Rose et al.
Frontiers in Microbiology, 2017, 8, ⟨10.3389/fmicb.2017.00955⟩
Article dans une revue hal-04258469 v1
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A pan-European epidemiological study reveals honey bee colony survival depends on beekeeper education and disease control

Antoine Jacques , Marion Laurent , Magali Ribière-Chabert , Mathilde Saussac , Stéphanie Bougeard et al.
PLoS ONE, 2017, 12 (3), pp.e0172591. ⟨10.1371/journal.pone.0172591⟩
Article dans une revue anses-03793136 v1
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Risk indicators affecting honeybee colony survival in Europe: one year of surveillance

Marie-Pierre Chauzat , Antoine Jacques , Marion Laurent , Stéphanie Bougeard , Pascal Hendrikx et al.
Apidologie, 2016, 47 (3), pp.348-378. ⟨10.1007/s13592-016-0440-z⟩
Article dans une revue hal-01532482 v1

Risk indicators affecting honeybee colony survival in Europe: one year of surveillance

Marie-Pierre Chauzat , Antoine Jacques , Marion Laurent , Stéphanie Bougeard , Pascal Hendrikx et al.
Apidologie, 2016, 47 (3), pp.348-378. ⟨10.1007/s13592-016-0440-z⟩
Article dans une revue anses-03793139 v1

Impact of colistin sulfate treatment of broilers on the presence of resistant bacteria and resistance genes in stored or composted manure

Laetitia Le Devendec , Gwénaëlle Mourand , Stéphanie Bougeard , Julien Léaustic , Eric Jouy et al.
Veterinary Microbiology, 2016, 194, pp.98-106. ⟨10.1016/j.vetmic.2015.11.012⟩
Article dans une revue istex hal-02488665 v1

Algorithms for multi-group PLS

Aïda Eslami , El Mostafa Qannari , Achim Kohler , Stéphanie Bougeard
Journal of Chemometrics, 2014, 28 (3), pp.192-201. ⟨10.1002/cem.2593⟩
Article dans une revue istex hal-02634546 v1

Multiblock modeling for complex preference study. Application to European preferences for smoked salmon

Stephanie Bougeard , Mireille Cardinal
Food Quality and Preference, 2014, 32 (Part A), pp.56-64. ⟨10.1016/j.foodqual.2013.06.002⟩
Article dans une revue hal-04499517 v1

Multivariate analysis of multiblock and multigroup data

A. Eslami , E. M. Qannari , A. Kohler , S. Bougeard
Chemometrics and Intelligent Laboratory Systems, 2014, 133, pp.63-69. ⟨10.1016/j.chemolab.2014.01.016⟩
Article dans une revue hal-05013509 v1

General overview of methods of analysis of multi-group datasets

Aida Eslami , Achim Kohler , El Mostafa Qannari , Stéphanie Bougeard
Revue des Nouvelles Technologies de l'Information, 2013, Advances in Theory and Applications of High Dimensional and Symbolic Data Analysis, RNTI-E-25, pp.108-123
Article dans une revue hal-05014438 v1
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Analyses factorielles de données structurées en groupes d'individus

Aida Eslami , El Mostafa Qannari , Achim Kohler , Stéphanie Bougeard
Journal de la Société Française de Statistique, 2013
Article dans une revue hal-05014378 v1

Multiblock redundancy analysis: interpretation tools and application in epidemiology

Stéphanie Bougeard , El Mostafa Qannari , Nicolas Rose
Journal of Chemometrics, 2011, 25 (9), pp.467-475. ⟨10.1002/cem.1392⟩
Article dans une revue hal-05017104 v1

Campylobacter from sows in farrow-to-finish pig farms: Risk indicators and genetic diversity

Martine Denis , Emmanuelle Henrique , Bérengère Chidaine , Annie Tircot , Stéphanie Bougeard et al.
Veterinary Microbiology, 2011, 154 (1-2), pp.163-170. ⟨10.1016/j.vetmic.2011.07.001⟩
Article dans une revue istex hal-04258588 v1
Image document

Multiblock redundancy analysis from a user's perspective. Application in veterinary epidemiology.

Stéphanie Bougeard , El Mostafa Qannari , Coralie Lupo , Claire Chauvin
Electronic Journal of Applied Statistical Analysis, 2011, 4 (2), ⟨10.1285/i20705948v4n2p203⟩
Article dans une revue hal-05017030 v1

Detection of Listeria monocytogenes in raw and pasteurized liquid whole eggs and characterization by PFGE.

Katell Rivoal , Stéphane Quéguiner , Evelyne Boscher , Stéphanie Bougeard , Gwennola Ermel et al.
International Journal of Food Microbiology, 2010, 138 (1-2), pp.56-62. ⟨10.1016/j.ijfoodmicro.2010.01.013⟩
Article dans une revue istex hal-00473747 v1
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Replication efficiency of rolling-circle replicon-based plasmids derived from porcine circovirus 2 in eukaryotic cells.

Florence Faurez , Daniel Dory , Aurélie Henry , Stéphanie Bougeard , André Jestin
Journal of Virological Methods, 2010, 165 (1), pp.27-35. ⟨10.1016/j.jviromet.2009.12.013⟩
Article dans une revue hal-00493407 v1

Influence of pesticide residues on honey bee (Hymenoptera: Apidae) colony health in France.

Marie-Pierre Chauzat , Patrice Carpentier , Anne-Claire Martel , Stéphanie Bougeard , Nicolas Cougoule et al.
Environmental Entomology, 2009, 38 (3), pp.514-23. ⟨10.1603/022.038.0302⟩
Article dans une revue hal-00417646 v1

Temperature sensitivity on growth and/or replication of H1N1, H1N2 and H3N2 influenza A viruses isolated from pigs and birds in mammalian cells.

Pascale Massin , Gaëlle Kuntz-Simon , Cyril Barbezange , Céline Deblanc , Aurélie Oger et al.
Veterinary Microbiology, 2009, epub ahead of print. ⟨10.1016/j.vetmic.2009.10.012⟩
Article dans une revue istex pasteur-00457734 v1
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Impact of deoxynivalenol on the intestinal microflora of pigs

Yann Wache , Charlotte Valat , Gilbert Postollec , Stephanie Bougeard , Christine Burel et al.
International Journal of Molecular Sciences, 2008, 10 (1), pp.1-17. ⟨10.3390/ijms10010001⟩
Article dans une revue hal-01985348 v1
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ACPVI multibloc. Application en épidémiologie animale

Stéphanie Bougeard , Mohamed Hanafi , El Mostafa Qannari
Journal de la Société Française de Statistique, 2007, 148 (4), pp.78-94
Article dans une revue hal-04506070 v1

Multiblock latent root regression. Application to epidemiological data

Stéphanie Bougeard , Mohamed Hanafi , El Mostafa Qannari
Computational Statistics, 2007, 22 (2), pp.209-222. ⟨10.1007/s00180-007-0036-1⟩
Article dans une revue istex hal-04506046 v1

Multiblock Analysis of Distributional Data

Paula Brito , Ndèye Niang , A. Pedro Duarte Silva , Stéphanie Bougeard
9th conference of Data Science, Statistics, and Visualisation (DSSV 2025), Jul 2025, Kruger National Park, South Africa
Communication dans un congrès hal-05153676 v1

Multiblock Analysis of Distributional Data

Paula Brito , Ndèye Niang , A. Pedro Duarte Silva , Stéphanie Bougeard
Symbolic Data Analysis Workshop 2025, Jun 2025, Varaždin, Croatia
Communication dans un congrès hal-05153737 v1

Prevalence and diversity of Integrative and Conjugative or Mobilizable Elements carrying antimicrobial resistance genes in Streptococcus suis

Manon Dechêne-Tempier , Stéphanie Bougeard , Valentin Loux , Hélène Chiapello , Virginie Libante et al.
International Conference on type IV secretion system, UMR1128 DynAMic; PROPULS', Feb 2025, Nancy, France
Communication dans un congrès hal-05286237 v1

Salmonella strikes harder in the presence of Campylobacter, fueling chicken colonization

Muriel Guyard-Nicodème , Guillaume Larivière-Gauthier , Cyrielle Payen , Laëtitia Bonifait , Sophie Mompelat et al.
I3S 2025, INNOZH, Jun 2025, Saint-Malo, France
Communication dans un congrès anses-05191637 v1
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Principal Components Analysis with Optimal Scaling: A way to integrate sensory analysis, physico-chemical measurements and experimental factors.

Evelyne Vigneau , Stéphanie Bougeard
AgroStat 2024, Société Française de Statistique (SFdS) & Polytechnic Institute of Bragança (IPB), Sep 2024, Bragança, Portugal
Communication dans un congrès hal-05039113 v1

Performance of infrared spectroscopy to predict serogroup and ability of adhesion of Listeria monocytogenes compared to genomic analysis

Evelyne Boscher , Stéphanie Bougeard , M. Guy , Emmanuelle Houard , Arnaud Felten et al.
ISOPOL XXI, Matthew Gilmour, Sep 2024, Norwich, UK, United Kingdom
Communication dans un congrès anses-04811451 v1

Epizootie d’Influenza Aviaire Hautement Pathogène en France en 2022-2023 : importance des facteurs environnementaux

Maryem Ben Salem , Mathieu Andraud , Stéphanie Bougeard , Sophie Le Bouquin , Virginie Allain et al.
15. Journées de la Recherche Avicole et Palmipèdes à Foie Gras, Mar 2024, Tours, France. pp.236-240
Communication dans un congrès hal-04539486 v1

Honey bee health in a world of pathogens and pesticides: measurement and interpretation of large data sets

Marie-Pierre Chauzat , Marion Laurent , Minh Huyen Ton Nu Nguyet , Lucile Caradec , Florence Ghestem et al.
Bee Health Symposium, Jun 2024, Madrid, Spain
Communication dans un congrès anses-04805742 v1

Mobile genetic elements that carry macrolide-lincosamide and tetracycline resistance genes in Streptococcus suis strains isolated in France

Manon Dechêne-Tempier , Eric Jouy , Virginie Libante , Stéphanie Bougeard , Sophie Payot et al.
5th International Workshop on Streptococcus suis, Jun 2023, Bangkok / Thailand, Thailand
Communication dans un congrès hal-04232467 v1

MBPCA-OS: an exploratory multiblock method for variables of different measurement levels. Application to study the immune response to SARS-CoV-2 infection and vaccination

Martin Pariès , Evelyne Vigneau , Adeline Huneau , Olivier Lantz , Stéphanie Bougeard
CARME (Correspondence Analysis and Related Methods), Sep 2023, Bonn, Germany
Communication dans un congrès anses-05040102 v1

Control of Salmonella in Powdered Infant Formula

Pauline Kooh , Moez Sanaa , Mickaël Boni , Stéphanie Bougeard , Bernard Caron et al.
International Symposium Salmonella and Salmonellosis, Jun 2022, Saint-Malo, France. pp.90
Communication dans un congrès hal-03845650 v1

Antigenic cartography sheds new light on infectious bursal disease virus diversity

Liliana L Cubas-Gaona , Céline Courtillon , François‐xavier Briand , Stéphanie Bougeard , Edouard Hirchaud et al.
Avian infectious diseases 2021, British microbiology society, Sep 2021, Pirbright, United Kingdom
Communication dans un congrès hal-04738984 v1

Apparition et sélection de variants d'un avibirnavirus soumis à diverses pressions de sélection lors de culture ex vivo basée sur des lymphocytes B aviaires

Liliana L Cubas-Gaona , Alexandre Flageul , Céline Courtillon , François‐xavier Briand , Maud Contrant et al.
XXIIIèmes Journées Francophones de Virologie, société française de virologie, Apr 2021, Montpellier, France
Communication dans un congrès hal-04738985 v1

Combined-information criterion for clusterwise elastic-net regression. Application to omic data

Stéphanie Bougeard , Xavier Bry , Thomas Verron , Ndèye Niang
8th Channel Network Conference, Cnam, Apr 2021, Paris, France
Communication dans un congrès hal-03541298 v1
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A new tool for multi-block PLS discriminant analysis: application to metabolomic data in systems epidemiology

Marion Brandolini-Bunlon , Mélanie Pétéra , Pierrette Gaudreau , Blandine Comte , Stéphanie Bougeard et al.
Conférence Chimiométrie 2020, Jan 2020, Liège, Belgium
Communication dans un congrès hal-02790379 v1
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A new tool for multi-block PLS discriminant analysis of metabolomic data: application to systems epidemiology

Marion Brandolini-Bunlon , Mélanie Pétéra , Pierrette Gaudreau , Blandine Comte , Stephanie Bougeard et al.
12. Journées Scientifiques du Réseau Francophone de Métabolomique et Fluxomique RFMF, May 2019, Clermont-Ferrand, France
Communication dans un congrès hal-02154660 v1

Quantifier, expliquer et réduire l’usage des antibiotiques en élevage porcin en Europe : bilan du projet MINAPIG

Lucie Collineau , Stéphanie Bougeard , Stéphane Krebs , Claire Chauvin , Catherine Belloc
50. Journées de la Recherche Porcine, Feb 2018, Paris, France
Communication dans un congrès hal-02734654 v1

Current multiblock methods: competition or complementarity? A comparative study in a unified framework

Stéphanie Bougeard , Ndeye Niang Keita , Thomas Verron , Xavier Bry
Agrostat 2018, Mar 2018, Marseille, France
Communication dans un congrès hal-02065531 v1
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Clusterwise multiblock PLS

Ndèye Niang , Stéphanie Bougeard , Gilbert Saporta
SFC 2018, Sep 2018, Paris, France
Communication dans un congrès hal-02471608 v1
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Clusterwise Sparse PLS

Stéphanie Bougeard , Ndeye Niang-Keita , Cristian Preda , Gilbert Saporta
PLS'17, Jun 2017, Macao, Macau SAR China
Communication dans un congrès hal-02475001 v1
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Prédiction en régression clusterwise PLS

Ndèye Niang , Stéphanie Bougeard , Gilbert Saporta
48 èmes Journées de Statistique, May 2016, Montpellier, France
Communication dans un congrès hal-02500605 v1

Regularized clusterwise multiblock regression

Stéphanie Bougeard , Ndèye Niang , Gilbert Saporta
Compstat 2016, Aug 2016, Oviedo, Spain
Communication dans un congrès hal-02500591 v1

Some Sparse Methods for High Dimensional Data

Gilbert Saporta , Anne Bernard , Stéphanie Bougeard , Ndèye Niang , Cristian Preda
H2DM International Workshop on High Dimensional Data Mining, Jun 2016, Naples, Italy
Communication dans un congrès hal-02500643 v1

Les méthodes « clusterwise » : principes et applications

Gilbert Saporta , Stéphanie Bougeard , Ndeye Niang-Keita
XXII èmes rencontres de la Société Francophone de Classification, Sep 2015, Nantes, France
Communication dans un congrès hal-02507509 v1

Clusterwise multiblock PLS

Ndeye Niang-Keita , Stéphanie Bougeard , Gilbert Saporta , Hervé Abdi
CARME 2015: Correspondence Analysis and Related Methods, Sep 2015, Napoli, Italy
Communication dans un congrès hal-02507449 v1

Clusterwise multiblock PLS regression

Ndeye Niang-Keita , Stéphanie Bougeard , Gilbert Saporta
CFE-CMStats, Dec 2015, London, United Kingdom
Communication dans un congrès hal-02507429 v1
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Analyse de (K+1) tableaux avec le logiciel ade4. Application en épidémiologie.

Stéphanie Bougeard , Stéphane Dray
1ères Rencontres R, Jul 2012, Bordeaux, France
Communication dans un congrès hal-00717559 v1
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Etudes des lésions pulmonaires chez le porc : una analyse symbolique sur des concepts issus de l'approche classique

Christelle Fablet , Carole Toque , Stéphanie Bougeard , Edwin Diday
42èmes Journées de Statistique, 2010, Marseille, France, France
Communication dans un congrès inria-00494799 v1
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ACPVI multibloc qualitative. Application en épidémiologie vétérinaire.

Stéphanie Bougeard , El Mostafa Qannari , Christelle Fablet
41èmes Journées de Statistique, SFdS, Bordeaux, 2009, Bordeaux, France, France
Communication dans un congrès inria-00386614 v1
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Acquisition de l'immunité passive chez des porcelets issus de truies Exemptes d'Organismes Pathogènes Spécifiques (EOPS)

Roland Cariolet , Isabelle P. Oswald , Gérald Le Diguerher , Stéphanie Bougeard , Anne Marie Cossalter et al.
39. Journées de la Recherche Porcine, Feb 2007, Paris, France
Communication dans un congrès hal-02756742 v1

Phenotypic and genotypic characterization of antimicrobial resistance in Streptococcus suis strains isolated in France, under a “One Health” approach.

Manon Dechêne-Tempier , Virginie Libante , Eric Jouy , Claire de Boisséson , Pierrick Lucas et al.
The One Health challenges to tackle infectious diseases, Jun 2024, Saint-Brieuc, France, France
Poster de conférence hal-05286331 v1

Factors contributing to the prevalence of Integrative and Conjugative or Mobilizable Elements carrying antimicrobial resistance genes in Streptococcus suis

Stéphanie Bougeard , Manon Dechêne-Tempier , Valentin Loux , Hélène Chiapello , Virginie Libante et al.
5th International Workshop on Streptococcus suis, Jun 2023, Bangkok / Thailand, Thailand
Poster de conférence hal-04232466 v1

Improvement of maldi-tof for the identification of Aeromonas salmonicida and Aeromonas bestiarum : two important fish pathogen

Jean-Sébastien Py , Maureen Feucherolles , Yann Vanrobaeys , Eric Jouy , Laetitia Le Devendec et al.
13. International Symposium on Aeromonas and Plesiomonas (ISAP), Jun 2023, Wroclaw, Poland. 2023
Poster de conférence anses-04168208 v1

Control of Salmonella and Cronobacter spp. in powdered infant formula

Pauline Kooh , Moez Sanaa , M. Boni , Stephanie Bougeard , Bernard Caron et al.
FoodMicro2022, Aug 2022, Athene, Greece. , 2022
Poster de conférence anses-03903055 v1

Les facteurs déclenchants de la colibacillose du poulet de chair : étude épidémiologique dans 80 élevages en France

Julie Puterflam , Pascal Galliot , Loïc Balaine , Isabelle Kempf , Laetitia Le Devendec et al.
14èmes Journées de la Recherche Avicole et des Palmipèdes à Foie Gras, Mar 2022, Tours, France
Poster de conférence hal-03775530 v1

Immunisation passive des poussins par l'administration d'un autovaccin aux poules reproductrices

Alassane Keita , Laetitia Le Devendec , Michel Amelot , Julie Puterflam , Camille Lucas et al.
14èmes Journées de la Recherche Avicole et des Palmipèdes à Foie Gras, Mar 2022, Tours (France), France. 2022
Poster de conférence anses-04082645 v1
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Detection of unknown genetically modified organisms (GMO) by statistical analysis of high throughput sequencing data

Julie Hurel , Mathieu Roland , Sophie Schbath , Stéphanie Bougeard , Mauro Petrillo et al.
JOBIM 2019, Jul 2019, Nantes, France. , 2019
Poster de conférence hal-02734732 v1

Acquisition de l'immunité passive chez des porcelets issus de truies exemptes d'organismes pathogènes spécifiques "EOPS

R Cariolet , Isabelle P. Oswald , G Le Diguerher , S Bougeard , Anne Marie Cossalter et al.
Journées de la Recherche Porcine, 2007, France. pp.Inconnu, 2007
Poster de conférence hal-02815333 v1